福王府一家人在洛阳过了一个还算安静祥和的新年，但在朝鲜，一场灾难已经降临了----正月初八，后金军开入了朝鲜，不过，此时后金的主要攻击目标不是朝鲜，而是东江镇，对此，金满文老档的记载是“天聪元年，岁在丁卯。时明毛文龙驻近朝鲜海岛，屡收纳逃人。我遂怒而往征之，若朝鲜可取，顺便取之”。
当时，刚刚登上后金汗位不久的阿巴海先是派人与镇守宁远的那位民科军事专家进行了虚与委蛇的假装和议，还以为骗了阿巴海，让后金中了自己“缓兵之计”的民科军事专家喜滋滋的上当了，而就在双方和议展开期间，阿巴海已经命令镶蓝旗旗主阿敏、镶白旗旗主阿济格、镶红旗旗主岳托，贝勒济尔哈朗、杜度、硕托，总兵李永芳等人率大军三万经由朝鲜境内，攻打东江镇占据的铁山大营，以解除后金的心腹之患。
对于后金的出兵人数，后来那位民科军事专家说有十万之众----"闻奴兵十万掠鲜、十万居守"----所以为了避免自己出兵后，被后金军抄了老家，所以他拒不提供任何援助，这是派人去给阿巴海送了一封信，让阿巴海退兵。
后来，东江镇的形势紧张，民科军事专家因为实在无法向朝廷交代了，这才小心翼翼的派遣了几百士卒向锦州方向实施侦察，结果没想到，居然一举收复了锦州、中左所等地，由此可见，他所谓的后金有十万军人守卫腹地，准备伏击辽镇出援部队的说法是那么的可笑，完全是坐观与自己不和的毛文龙惨败，乃至覆灭。
其实不单单是民科军事专家认为东江镇救不了了，朝鲜方面一样认为毛文龙此战必败，所以，为自保，黄海道的朝鲜地方官员便倒向后金一方，向后金大军提供朝鲜服装（"引贼俱换丽帽丽服"）冒充朝鲜军围攻铁山。
铁山都司毛有俊等率千余名守军与后金大军血战，战至最后一卒，无人肯降，最终毛有俊拔刀自刎，壮烈殉国，铁山守军全军覆没。
攻占铁山后，志得意满的后金军主帅阿敏便又指挥后金铁骑乘冬季沿海海冰坚实的有利条件，对距离铁山仅三里之隔的云从岛发起了猛攻。
已经接到警报的毛文龙率部率部严阵以待，拼死抵抗后金的进攻----尽管后金大军人多，骑兵精锐，但守军工事完备，枪炮犀利，所以两军鏖战良久，依旧不分输赢。
不过为了抵御强大的后金军，东江镇这边的弹药消耗极大，眼见得，打着打着，弹药即将耗尽，毛文龙便在不得已的情况下，派遣养孙毛有见、毛有德及大将尤景和等人率东江军1000勇士，手持枪炮火器，踏上冰面，分路向后金大军发起夜袭。
阿敏等人全然没有想到皮岛东江军兵少将寡，处于被动之下，竟然派出精锐发起夜袭，惊慌之下，应变不及，被东江军一番冲突，顿时吃亏不小，然而，后金出动的军队数量始终是超过东江镇的，精锐程度更不是东江镇能比的，所以，当阿敏果断调整战术后，毛有见、毛有德以下东江军700勇士全部阵亡殉国。
但东江镇将士的血勇给阿敏等后金军指挥官以深刻的印象，因此在稍后的几次进攻中又损失了不少人手的后金主帅阿敏，见占不到东江镇半点便宜，便迁怒于朝鲜人，转而进攻朝鲜义州和安州，攻破城池，大开杀戒，并准备夺取朝鲜全境，然后就地称王建国。
引狼入室的朝鲜方面根本挡不住后金军的进攻，见到朝鲜这个柿子太软，阿敏便愈发肆无忌惮了，于是又率大军扑向朝鲜首都王京。
朝鲜国王李倧一面仓皇出逃，一面遣使向明朝和毛文龙请罪，说导敌不是自己的主意，而是臣子所为，请求援救。
天启皇帝接到朝鲜的求援后，认为朝鲜虽然协助后金，但不应该计较属国的过错，才是天朝气量。于是下诏给毛文龙，是什么"奴兵东袭毛帅，锐气未伤，深慰朕怀。丽人导奴入境，固自作孽，但属国不支，折而入奴，奴势益张，亦非吾利。还速谕毛帅相机应援，无怀宿嫌，致误大计"，让毛文龙立刻整军出战，救援朝鲜。
毛文龙接到诏书以后，不顾东江镇粮饷短缺的隐患，毅然率部进入朝鲜，反击后金大军。
在天寒地冻的环境中，东江镇官兵衣不蔽体，食不果腹，每日"拉死尸为食"，仍在毛文龙的激励下，顽强作战，与后金军在宣州、晏庭、车辇、义州等地反复拉锯，并在瓶山一线重创后金正蓝、镶白两旗，给予了后金军极大的杀伤。
更让后金雪上加霜的是，随着天气逐渐转暖，河流化冻，侵朝的后金军似乎已经陷入了东江镇和朝鲜义兵组织的天罗地网中。
然而，关键时候，被迫逃亡到江华岛躲避的朝鲜王廷却利用这一局面与后金方面达成和平；已经进退两难的阿敏，立刻抓住了这个机会，与朝鲜方面达成了“江都会盟”，约定朝、金结为兄弟之邦，双方各守边境，后金撤军，永不南下。
朝、金和约达成后，朝鲜官府立刻通知各地义兵停止对后金的袭击，同时禁止义兵帮助东江镇，正是朝鲜方面对东江镇的又一次背信弃义，这让让后金军得以带着从朝鲜抢掠来的财富冲破了东江镇和朝鲜义兵组织的包围，返回了后金控制区。
"丁卯之役"使得阿巴海用军事手段解决东江镇明军的战略彻底失败了，他不得不转而寻求外交和政治手段解决的途径，"通款崇焕，求杀文龙"；但是，他至少利用明军削弱了牛录比自己还多的（阿敏的）镶蓝旗、（阿济格的）镶白旗的实力，解除了此二人对其汗位的威胁，可以说，无论后金"丁卯之役"在军事上成功与否，对阿巴海个人来讲，都是胜利的。
对于明朝来说，"丁卯之役"使得拥有数万骄兵悍将的镶蓝旗精锐丧尽，即使休整两年也未恢复元气，其余参战后金军也多有损失。是为明军与后金交战以来，所取得的最重大胜利，而这又是在明军极为艰苦的环境下所取得的，更加可贵。
对此，登莱巡抚李嵩评价说:"奴以十万之众蹂躏东江，毛文龙乃能于狂烽正炽之际，奋敌忾迅扫之威······毛帅之功于是乎不可及矣!"
而在“丁卯之役”中损失最大的朝鲜方面也愈发的敌视后金了----虽然，这并不妨碍朝鲜向后金提供岁贡----但这恰恰又为后来爆发的丙子之役预埋了伏笔······