这边，宋江兵将，攻打睦州未见次第。忽闻探子来报，清溪救兵到了。宋江听罢便差王矮虎，一丈青两个出哨迎敌。夫妻二人带领三千马军投清溪路上来。正迎着郑彪首先出马，便与王矮虎交战。两个不搭话，排开阵势交马便斗。才到八九合，只见郑彪口里念念有词，喝声道“疾”！就从头盔顶上流出一道黑光来。黑气中立着一个金甲大神，手持降魔宝杵，从半空中打将下来。
王矮虎看见吃了一惊，手忙脚乱，失了枪法。被郑魔君一枪戳下马去。一丈青看见戳了她丈夫落马，急舞双刀去救时，郑彪便来交战。战到一回合时，郑彪回马便走。一丈青报仇心切，急赶将来，郑魔君歇住铁枪，舒手去身边锦带摸出一块度金铜砖，扭转身看在一丈青面门只一转打落下马而死。可怜能干佳人到 此一场春梦。那郑魔君招转军马赶宋兵去了。
宋兵大败，回见宋江，述说王矮虎，一丈青都被郑彪打死，带去的兵也折其大半。宋江听又折里王矮虎，一丈青，心中大怒。急急点起军马，引了李逵，项充，李衮，带了五千人马，前去迎敌。早见郑魔君军马已到。宋江怒气填胸，当先出马，大喝郑彪道 “孽贼怎敢杀吾二将！”
郑彪提枪出马要战宋江，李逵见了大怒，挚起两把板斧，便飞奔出去。项充，李衮，几舞蛮牌遮护。三个直冲杀到郑彪怀里去。郑彪回马便走，三个人赶入南兵阵里去。此时宋江急叫鸣金收兵。
两个牌手挡得李逵回来，只见四下里乌云闭合，黑气漫天，不分南北东西，白昼如夜。宋江军马前无去路，但见阴云四合。黑雾漫天下，一阵风雨徬沱，起数怒雷猛烈。山川震动，高低浑似天崩，溪间颠狂。左右却如地陷。悲悲鬼哭，哀哀神嚎。定睛不见半分形，满耳惟闻千树响。
宋江军兵当被郑魔君使妖法，黑暗了天地。撞到一个去处，黑漫漫不见一物，本部军兵便自乱起来。宋江仰天长叹“莫非吾当死于此地矣！”从已时到未牌，方才黑雾消散。微有些光亮。此时又看见一周遭金甲大汉，团团围住，宋江见了惊倒在地。口中只称“乞赐早死！”不敢仰面。
耳边只听得风雨之声，手下官兵个个伏地受死，只等刀来砍杀。须臾，风雨过后，宋江却见刀不砍来，有一人来搀护宋江，看那人头裹乌纱唐巾，身穿白罗圆领衫，腰系乌樨金束带。足穿四缝干皂朝靴，面如傅粉，唇若涂朱。堂堂七尺之躯，楚楚三旬之上。
若非上界灵官，定是九天进士！
宋江见了吃惊，起身叙礼，便问秀才高姓大名，那秀才答道“小生姓邵名俊。土居于此。 今特来报知文士，方十三气数已尽，只在旬日可破。小生多与义士出力，今虽受困，救兵已至。义士知否？
宋江再问道“先生，方十三气数何时可获”方秀才把手一推，宋江忽然惊觉，乃是南柯一梦。醒来看是一周遭大汉原来都是松树。宋江急叫军将起来，寻路出去。此时雾敛云收，天朗气清。只听得松树外面呐喊将来，宋江便领齐军兵，从里面杀出去时，早望见武松，鲁智深一路杀来，正与郑彪交手。那包天师杀武松使两口戒刀。武松步行直取郑彪，包天师便向鞘中挚出口玄浑天剑来，从空中飞下，正砍中武松左臂，武松立时血晕倒了。
幸得鲁智深一条禅仗奋力打去，救得武松时左臂已是伶丁将断。却夺得那把浑天剑。武松醒来时，看见左臂已断，一发狠自把戒刀割断了。宋江急叫军校护送他回寨将息。鲁智深却杀入后山去，正遇着夏候成交战，两个斗了数合，夏候成败走，鲁智深一条禅仗打入去，南军四散。夏侯成望山林奔走，鲁智深不舍，赶入山林去了。
此时，郑魔君又引兵赶将来，宋军内，李逵，项充，李衮，三个见了便舞蛮牌，飞刀。标枪，板斧一起冲杀个去，那郑彪迎敌不过，越岭渡溪而走。而这三个不识路径，只想立功，便死命赶过去，紧追郑彪。
溪西岸边，突然冒出三千兵来，截断宋兵。项充急回时，早被岸边两将拦住，他急叫李衮，李逵时且都过溪追郑彪去了。而李衮在溪边又一跤跌翻在溪里，被南军乱箭射死。项充急钻下岸来，但被索链跘翻。却待要挣扎，那众军乱上被剁成肉泥。可怜李衮，项充到此英雄怎使啊！
只有李逵，一个赶入深山去了，溪边军马随后袭将去，未经半里，背后喊声振起，却是花荣，秦明，潘瑞三将引军来救。杀散南军，赶入深山，救的李逵回来。只不见了鲁智深。
众将齐来参见宋江，诉说追赶郑彪，过溪厮杀，折了项充，李衮，只救了李逵回来。宋江听了痛哭不止。整点军马时，又不见了鲁智深。武松已折了左臂。
此时，卢俊义已在歙州城内行宫歇下，平复了百姓。出榜安民将军马屯驻在那里。一面差人赏文报捷张招讨，驰书转达宋先锋知令进兵。
这边宋江等兵将已在睦州屯驻，等候军齐，同攻方腊贼洞。收得鲁俊义书报平复了歙州，军将已在城中屯驻，专候进兵同取贼巢。又见折了史进，石秀，杨春，李忠，薛永，欧鹏，张春，丁得孙，单廷桂，魏定国，李云，石勇，陈达。一十三人。许多将佐烦劳不已，痛苦哀伤。
军师吴用劝道“死人皆分定数，主持何必自伤元体。且请料理国家大事。”宋江道“虽然如此，不由人不伤痛！想咱当初石竭天记载一百八人，谁知到此渐渐凋零 ，损吾手足！
吴用劝了宋江后便回书与卢俊义，交约日期起兵攻取清溪县。
宋江等大队人马都入清溪县来，众将杀入方腊宫中，收拾违禁器杖，金银珠宝，搜检内里库藏，就殿里放起火来，把方腊内外宫殿烧毁。府库钱粮搜索一空。宋江会合卢俊义军马，屯驻在清溪县内，聚集众将都来请功受赏。
整点两处将佑时，长汉郁保四，女将孙二娘，都被杜微飞刀伤死。邹渊，杜迁，马军中踏死。李云，汤隆，蔡福各带重伤。医治不好身死。阮小五先在清溪县已被娄丞相杀死。
众将擒提得南国伪官九十二员请功。赏赐后，不见了；娄丞相，杜微下落。后张榜文安抚百姓，把那活捉伪官解赴张招讨军前宰首示众。后有百姓报说，娄丞相杀了阮小五，自缢于松树林而死。杜微躲在娼妓家中被他社老献将出来。
宋江赏了社老，又令人先取了娄丞 相首级。叫蔡庆将杜微剖腹挖心，滴血祭秦明，阮小五，郁保四，孙二娘，并打清溪亡的众将。
宋江亲自捻香祭拜已了，次日与卢俊义起军，直抵帮源洞口。
当入帮源洞中，杀得尸横遍野，流血成渠。从“宋鉴”所载，斩杀方腊军二万余级。当下宋江传令教四下举火烧毁宫殿，龙楼凤阁，内外深宫，珠轩翠阁尽皆焚化。
当日宋江引军来洞屯驻，下了寨栅，计点生擒人数，只有贼首方腊未曾获得。传下将令，教军将沿山搜捉。
这方腊从帮源洞落路逃走后，便望深入旷野，透岭穿林，脱了锗黄袍舍去金花晃头，又脱下朝靴，穿上草屦蔴鞋，爬山奔走要逃性命。
当他连也爬过五个山头走到一处山凹里，见一个草阉嵌在此，方腊肚中肌我待要去草阉讨些吃食，只见松树后面转出一个胖大和尚来，一禅杖将他打翻，取来绳索绑了。
那和尚不是别人，正是花和尚鲁智深。他拿了方腊到草阉去些饭食吃后正解除山来。正迎着搜山的军将一同绑住来见宋江。宋江见后大喜。便问道“吾师，你如何正等着这贼首”？鲁智深道“洒家自从乌龙岭上万松林厮杀追赶夏候成入深山里走呗洒家杀了贪贼战兵，直赶入乱山深处迷失踪径，迤逦寻路去到旷野琳琅山内，忽遇一老僧 引洒家到此处矛阉嘱咐道“柴米菜蔬都有，你只在此间等候。但见个长大汉从林深处来，你便捉住。
夜来望见山前火起，小僧看了一夜，又不知此间山径路数是何路数。今早已
见这贼爬个山来因此俺一杖就打翻捉住。不想正是方腊!
宋江道“那一个老僧今在何处？”鲁智深道“那老僧引小僧到茅庵里，分付了柴米出来竟不见了。”宋江道“那和尚眼见得是圣僧罗汉。今吾师成此大功，回京奏闻朝廷，可以还俗为官。在京图个荫子封妻，光耀祖宗。报答父母之恩
鲁智深道“洒家心已成灰，不愿为官，只图寻个净出去，安身立命足矣！
宋江道“吾师既不肯还俗，便到京师去住持一个名山大刹，为一僧首，也贵显宗风。亦报答父母。”智深摇头道“都不要，要多也无用。只图个囫囵尸首便足了。”宋江听了默上心来，各不喜欢。点本部将佑俱已数足。将方腊装车解上东京，面见天子。于是便催起三军，带领诸将离了帮源洞清溪县都回睦州了。
再说半月中间，朝廷天使到来，奉圣旨令先锋宋江等班师回京。
张招讨，童密枢，都智，刘光也，大将王禀，赵译，
中军人马等已陆续回京师去了。宋江随即收拾兵马回京。比及起程，不想林冲荣染患风瘫病了。杨雄发背疮而死，时迁又感搅肠痧而死。宋江见了感伤不已。
丹徒县又传文书来报说杨志已死。葬于本县山圆。林冲瘫病不愈 就留在六和寺中，教武松看视后半载
而死。